مجالات التخصص

يركز البحث في مختبر Osley على دور الكروماتين في التعبير الجيني ، وتكرار الحمض النووي ، وإصلاح كسر الحمض النووي المزدوج. نحن نستخدم الكائن الحي النموذجي ، Saccharomyces cerevisiae ، للتحقيق في هذه العمليات الخلوية في الخلايا الهادئة ، والتي تمثل خلايا غير قابلة للنمو ولكنها قابلة للحياة في المرحلة G0 من دورة الخلية.osley-1.jpeg

إبيجينوم الخلايا الهادئة: باستخدام الأساليب الجينية ، ركزت دراساتنا الحديثة على دور الكروماتين في تطوير الخلايا الهادئة التي تتشكل في المرحلة الثابتة بعد استنفاد الجلوكوز. أظهرت هذه الدراسات الاحتفاظ بالعديد من علامات مثيلة الهيستون و RNA polymerase II على الجينات غير النشطة في الخلايا الهادئة ، مما يشير إلى أن الإيبيجينوم للخلايا الهادئة يهيئ هذه الخلايا لاستئناف النمو عند استعادة العناصر الغذائية.

تعتبر خلايا الخميرة الهادئة أيضًا نموذجًا ممتازًا لدراسة العمر الزمني. نحن نجري شاشة جينية لطفرات تعديل هيستون لتحديد تعديلات هيستون بعد الترجمة المطلوبة لتطوير الخلايا الهادئة وبقائها على المدى الطويل.

برنامج تكرار الحمض النووي للخلايا الساكنة: تدخل الخلايا الهادئة مرة أخرى في دورة الخلية وتستأنف الانقسام عند استعادة الجلوكوز. باستخدام الأساليب الجزيئية والجينية والجينومية ، نحدد البرنامج الذي يبدأ تكرار الحمض النووي في خلايا G0 الهادئة في ظل هذه الظروف ومقارنته بالبرنامج الذي يحدث عندما تدخل خلايا G1 المرحلة S. وجدت بياناتنا اختلافات كبيرة في برامج بدء الحمض النووي بين خلايا G1 و G0.

إصلاح الحمض النووي في الخلايا الهادئة: تقاوم الخلايا الهادئة العديد من العوامل المدمرة للحمض النووي ولكنها أكثر حساسية للإشعاع فوق البنفسجي من الخلايا النامية وتراكم المزيد من الطفرات في جينومها. نحن نجري تحليلات جزيئية وجينية وجينومية لتحديد المسارات والآليات التي تساهم في زيادة الطفرات التي تسببها الأشعة فوق البنفسجية في هذه الخلايا.

المنشورات الرئيسية

Young و CP و Hillyer و C و Hokamp و K و Fitzpatrick و DJ و Konstantinov و NK و Welty و JS و Ness و SA و Werner-Washburne و M و Fleming و AP و أوسلي ، ماساتشوستس: يتم إنشاء ملفات تعريف هيستون مثيلة ونسخ مميزة أثناء تطور الهدوء الخلوي في الخميرة. علم الجينوم BMC. 26 يناير ؛ 18 (1) ، 2017.

Wiest و NE و Houghtaling و S و Sanchez و JC و Tomkinson و AE و أوسلي ، ماساتشوستس. يعزز مُعيد تشكيل النوكليوسوم المعتمد على SWI / SNF ATP بدء الاستئصال عند كسر الحمض النووي المزدوج في الخميرة. أبحاث الأحماض النووية 45: 5887-5900 ، 2017.

Trujillo و KT و أوسلي ، ماساتشوستس: دور لوجود H2B في كل مكان في تكرار الحمض النووي ، خلية مول ، 48: 734-746 ، 2012.

Shieh ، GS ، Pan ، CH ، Wu JH ، Sun ، YJ ، Chang ، KW ، Tung ، L ، Chang ، TH ، Fleming ، A ، Hillyer ، C ، Berger ، SL ، أوسلي ، ماساتشوستس * و Kao ، CK *: يعد انتشار H2B في كل مكان جزءًا من بنية الكروماتين التي تميز بنية exon-intron في الخميرة الناشئة. BMC الجينوم. 22 ديسمبر ؛ 12 (1): 627 [النشر الإلكتروني قبل الطباعة] ، 2011.

Houghtaling و S و Tsukuda و T و أوسلي ، ماساتشوستس: المقايسات الجزيئية للتحقيق في تغيرات الكروماتين أثناء إصلاح كسر الحمض النووي المزدوج في الخميرة. طرق في علم الأحياء الجزيئي، 745: 79-97، 2011.

Nakanishi ، S ، Lee ، JS ، Gardner ، JM ، Takahashi ، Y ، Chandrasekharan ، Sun ، ZW ، أوسلي ، ماساتشوستس، Strahl، B، Jasperson، SL، Shilatifard، A: هيستون H2BK123 أحادي الاتجاه هو المحدد الحاسم لثلاثي الميثيل H3K4 و H3K79 بواسطة COMPASS و Dot1. J سيل بيول، 186: 371-377، 2009.

تسوكودا ، تي ، لو ، واي سي ، كريشنا ، إس ، ستيرك ، آر ، أوسلي ، ماساتشوستس، and Nickoloff، J: إعادة تشكيل الكروماتين المعتمد على INO80 ينظم المراحل المبكرة والمتأخرة من إعادة التركيب المتماثل الانقسامي. إصلاح الحمض النووي، 8: 360-360، 2009.

Fleming و AB و Kao و CF و Hillyer و C و Pikaart و M و أوسلي ، ماساتشوستس: يلعب انتشار H2B دورًا في ديناميكيات الجسيمات النووية أثناء استطالة النسخ. مول الخليوي، 31: 57-66، 2008.

Xiao، X، Kao، CK، Krogan، N، Greenblatt، J، Sun، ZW، أوسلي ، ماساتشوستس، و Strahl ، B: يرتبط انتشار H6B المعتمد على Rad2 بإطالة بوليميريز RNA II.  مول. زنزانة. بيول. 25: 637-651، 2005.

Tsukuda و T و Fleming و A و Nickoloff و JA و أوسلي ، ماساتشوستس: إعادة تشكيل الكروماتين في موقع فاصل مزدوج للحمض النووي في خميرة الخميرة. طبيعة سجية X