تعتبر الكوليرا نموذجًا رائعًا لفهم العديد من جوانب وبائيات أمراض الإسهال بسبب الطبيعة المتفجرة لتفشي المرض والبراز المميز الذي يحتوي على ماء الأرز. بناءً على تحقيقاتنا الأكثر تركيزًا حول انتقال العدوى ، ينصب تركيزنا على كيفية استخدام هذه المعلومات الجينومية على المقاييس المكانية ذات الصلة بتدخلات الصحة العامة ، مثل الأسر أو المناطق. نحن مهتمون أيضًا بفائدة التسلسل في الوقت الفعلي لتقديم تقديرات مستقلة للمعلمات الوبائية الرئيسية ، مثل R₀ وتقديرات العدد الإجمالي للحالات. باستخدام هذه الأدوات ، يمكننا تقديم تنبؤات أفضل حول المكان الذي قد يحدث فيه تفشي الكوليرا التالي ويمكننا تصميم تدخلات منطقية وقائمة على الأدلة لوقف الكوليرا في المناطق المنكوبة

بدءًا من مارس 2020 ، تكيف مختبري سريعًا للعمل على تسلسل جينومات SARS-CoV-2 ، الفيروس المسؤول عن وباء COVID-19 الحالي. جنبًا إلى جنب مع مختبر Darrell Dinwiddie (UNM) ، نحن قائد التسلسل والجينوميات في نيومكسيكو ووايومنغ ، كما أننا جزء من اتحاد CDC-SPHERES. نحن نعمل عن كثب مع إدارتي الصحة في NM و WY ، ومختبر Los Alamos الوطني ، بالإضافة إلى مرافق الاختبار الإقليمية للحصول على العينات وتقديم التحليل ذي الصلة بتحليل تفشي المرض وتاريخ انتقال الفيروس عبر منطقة Mountain West. بهذه الصفة ، قمنا بتسلسل ما يقرب من 1,000 جينوم فيروسي من دول عبر المنطقة. هدفنا هو تقديم بيانات قابلة للتنفيذ إلى مسؤولي الصحة العامة لدينا حول كيفية انتشار SARS-CoV-2 داخل المجتمعات والدول وبينها.

لدينا أيضًا اهتمام كبير بتطبيق تقنيات علم الأوبئة الجينومية لفهم كيفية تحرك الجينات المقاومة لمضادات الميكروبات عبر التجمعات البكتيرية والضغوط التي تدفع هذا الانتشار. يساهم الاستخدام غير المناسب لمضادات الميكروبات في كل من الطب البشري والحيواني في زيادة المقاومة في مسببات الأمراض البكتيرية الرئيسية ، مثل Salmonella sp. والإشريكية القولونية. نظرًا لأن صحة البشر تعتمد على صحة البيئة وصحة الحيوان (أي صحة واحدة) ، فإن فهم كيفية انتقال جينات مقاومة مضادات الميكروبات ومسببات الأمراض المقاومة بين الحيوانات والإنسان والبيئة هو أمر بالغ الأهمية