المباحث الجينومية

يدرس علماء UNM اختلافات الفيروس التاجي بحثًا عن أدلة حول ما سيحدث بعد ذلك

كفيروس كورونا الجديد - المعروف للعلماء باسم SARS-CoV-2 - يتكاثر وتظهر الاختلافات في شفرته الجينية. تتراكم هذه التغييرات بمرور الوقت ، مثل بصمات الأصابع ، مما يترك أثرًا منبهاً من القرائن حول مكان وجود الفيروس ، وإلى أين يمكن أن يتجه.

علماء جامعة نيو مكسيكو داريل إل دينودي ، دكتوراه ، وداريل دوممان ، دكتوراه ، هم لعب دور المحققين الجينوم الذين يحاولون حل القضية.

إنهم جزء من اتحاد وطني تم تشكيله حديثًا من جامعات الأبحاث وإدارات الصحة العامة التي تسعى إلى تتبع المرض. البرنامج الذي أطلق عليه اسم SARS-CoV-2 SPHERES ، يرعاه المركز الوطني للأمراض المعدية الناشئة والحيوانية (فرع من مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها) كوسيلة لتجميع المعلومات الهامة حول الفيروس.

قام Dinwiddie ، الأستاذ المساعد في قسم طب الأطفال بجامعة UNM ، بتسلسل مئات عينات فيروس كورونا التي تم الحصول عليها من وزارة الصحة في نيو مكسيكو ومختبر وايومنغ للصحة العامة في مختبر الجينوم الجزيئي الخاص به خلال الأسابيع القليلة الماضية.

يقول: "لقد أكملنا مؤخرًا أول 48 جينومًا من نيو مكسيكو". "هناك مؤشر قوي على أن غالبية الإصابات الأولى في الولاية كانت مرتبطة بالسفر من جميع أنحاء العالم."

Dinwiddie يتعاون في التحليل مع Domman ، دكتوراه ، أستاذ مساعد في قسم الطب الباطني. يقول دينويدي: "إنه يفعل الكثير مما نسميه علم الأوبئة الجينومية" ، مضيفًا أن دومان لديه خبرة في متابعة تفشي الكوليرا في جميع أنحاء العالم. "نحن نستخدم طرقًا متشابهة جدًا لفحص SARS-CoV-2."

يتم ترميز جينوم الفيروس التاجي الجديد في خيوط من جزيء يسمى RNA. توفر التغييرات الطفيفة في تسلسل النيوكليوتيدات في الخيط معلومات حول مدى ارتباط عينة فيروسية بأخرى.

يعمل العلماء مثل Dinwiddie و Domman بجد لبناء مكتبة من هذه العينات لإنشاء شجرة عائلة فيروسية.

يشير تحليل أولي للعينات التي تم جمعها في نيومكسيكو إلى أنه كانت هناك عدة حالات دخول للفيروس إلى الولاية ، وهو ما يتوافق مع التقارير المبكرة للحالات بين الأشخاص الذين سافروا إلى الخارج أو محليًا.

ويضيف: "يمكننا القول أيضًا من التحليل الجينومي المبكر أن غالبية العينات أكثر تشابهًا مع السلالات القادمة من أوروبا أو نيويورك". "نحن لا نرى الكثير من الأشخاص المرتبطين ارتباطًا وثيقًا بتلك الموجودة في الصين."

الاختلاف الجينومي في التكاثر الفيروسي هو عملية طبيعية. يقول Dinwiddie: "بالنسبة إلى SARS-CoV-2 S ، كان معدل التغيير الجيني مستقرًا إلى حد ما". "نحن نعرف مدى سرعة تغيرها. بناءً على هذه المعلومات يمكننا عمل تنبؤات حول مدى رجوع العينات المختلفة."

يتم أخذ العينات الفيروسية من مسحات الأنف التي تم جمعها من المرضى الذين ثبتت إصابتهم بفيروس كورونا. يقول دينويدي إنه يتم التعامل معها باستخدام إجراءات السلامة الحيوية ويتم تعطيلها حتى لا تصبح معدية.